Auch in Sachen KI setzt Crysis noch einen drauf. Gegner können zwar nicht durchs Gebüsch schauen, nehmen aber die Bewegungen des Spielers wahr. Man kann also nicht unbemerkt durch den Wald laufen. Im Laufe des Spiels schließen sich die Streitkräfte zusammen, doch wie sie auf euch reagieren kann sich immer ändern. Tötet man etwa einen wehrlosen Koreaner wird der jeweilige General vielleicht bescheid wissen und wichtige Informationen oder Ausrüstung zurückhalten.
Mitstreiter loben einen auch, wenn man viele Aliens wegpustet.